这天，小智一行人来到了野生宝可梦保护区，结识了拉拉美家族的富子。不过小智一行人并没有逗留，因为小智急于去宝可梦狩猎地带。富子听到小智要去狩猎地带，就亲自送小智一行人到达狩猎地带，送小智一行人到狩猎地带后，富子就返回了家族。而一直跟小智一行人的火箭队三人组，也跟着进入了狩猎地带。
小智一行人来到了一座钢铁建的房子前，小智敲了敲门，有点激动地冲着屋里问道：“请问有人在吗？我们是来狩猎地带收服宝可梦的。”
一个大叔开门后对小智一行人不耐烦地说道：“吵死了，知道了！知道了！”看来这个大叔的脾气不太好，随后大叔又自我介绍说：“我叫凯撒，是狩猎地带的管理人。”可能是因为小智有礼貌些，所以凯撒只带着步枪出来，并没有将枪口对准小智一行人。不然小智不介意学一下燕双鹰给大叔来一句“我最讨厌别人用枪指着我的脑袋。”
进入了屋里后，小智看到凯撒大叔拿出的绿色精灵球和钓竿兴奋地说道：“哇！是狩猎球和钓竿耶！有了这些就可以得到宝可梦了！”
凯撒大叔随后跟小智一行人讲了狩猎地带的规矩，小智一行人点了点头，表示清楚了。
这时，正看着墙上照片的小霞突然说道：“嗯？这个该不会就是迷你龙吧？和它拍照的是凯撒先生吧？好年轻啊！”听到小霞的话后，凯撒大叔立刻跑过来把照片拿走，然后说道：“不对，这里才没有迷你龙。”
小智已经迫不及待去收服这里的宝可梦了，就对小霞说：“好了，不要管那么多了，我们还是赶紧去收服宝可梦吧。”于是，一行人就出发去收服宝可梦了。
小智一行人并没有走在一起，而是在小智的建议下分开了。
分开之后，小智独自一人刚走几步，地面就开始仿佛地震一般震动起来，原来是一群肯泰罗在奔跑着，小智并没有像原剧情一样抓了三十只，而是只扔了两颗狩猎球，收服了一对肯泰罗。
然后小智就朝着原剧情中有迷你龙的湖泊走去。刚走到半路，小智突然发现一只袋兽，袋兽此时正在与一只尼多王比拼力量，最终袋兽以微弱的优势胜利了。然后小智从袋兽的背后扔出了狩猎球，袋兽还不知道是怎么回事就被小智收服了。
小智继续向前走去，来到了一处平坦的草地上。看到远方有两只火红的宝可梦正快速地向这边冲过来，随着不断地接近，小智看清是一只烈焰马和一只风速狗在赛跑，路过小智身边的时候，两颗狩猎球迅速丢向风速狗和烈焰马，将它们收服了。
小智又接着往前走去，来到了湖边，小智知道这里就是龙之谷了。湖面上有几根白色的柱子，而湖边上有许多蚊香蝌蚪和蚊香君在嘻戏，小智并没有去收服它们，而是拿出钓竿开始垂钓。不一会儿就有宝可梦咬钩了：大钳蟹，大舌贝，蚊香蝌蚪，角金鱼，鲤鱼王，刺甲贝，金鱼王等水系宝可梦。小智只收服了一只刺甲贝和一只金鱼王，其它的都被小智放了回去。
小智刚收服完两只宝可梦，准备收竿，就看到了一只迷你龙正在好奇地望着自己，而皮卡丘则和迷你龙交流，很快就玩到了一起。于是小智也收起钓竿，放出杰尼龟和海星星一起跟迷你龙玩。大家在一起非常开心地度过了一段时间。
小智看了看时间，觉得差不多该走了，于是，便开始收拾一下东西。当小智蹲下身体收拾迷你龙旁边的钓竿的时候，迷你龙不小心碰到了小智腰间的空精灵球，然后小智不知怎么回事就收服了迷你龙。
“啊？迷你龙！”小智看到迷你龙进入精灵球后，呆呆地露出疑惑的表情，回过神后，立刻就将迷你龙放出来。本以为迷你龙会害怕，然后走掉。谁知迷你龙非常亲昵地缠上了小智的脖子。小智大胆猜测迷你龙可能会跟自己走，于是对迷你龙说道：“迷你龙，你想跟着我？对吗？”然后迷你龙就点了点头。小智知道这里有一只哈克龙，是迷你龙的母亲，所以又对迷你龙说道：“迷你龙，你先去见一见你的妈妈，我去接一下我的两个旅行伙伴，我们一会儿再见。”迷你龙听了小智的话后，一下就钻进了水里。小智也收拾好东西，去找小霞和小刚了。
在约定的地方集合后，小智和小霞都收服到了一些宝可梦，小刚则是一只也没有收服。这让小智也是哭笑不得。
这时，凯撒大叔被一个机器绑缚着大喊道：“快点帮我把它拿下来啊。”小智跑过去把机器拿下来。小刚赶紧问道：“怎么回事？”凯撒大叔着急地说：“没时间解释了，快点去救迷你龙啊！”
于是，凯撒大叔带着小智一行人来到龙之谷。小智一行人看到火箭队拿着一个水中麻痹炸弹，小智立刻喊道：“住手！火箭队！”
“小鬼头，已经晚了。”说完，武藏就将炸弹扔进水中，“可恶！”小智见状暗骂一声，便立马跳入水中，开启自己的波导之力在水中找炸弹。
凯撒大叔本来也想跳入水中帮忙的，但是被小霞和小刚拉住了。小智在水中不断地下潜，终于在湖底找到了炸弹。就在小智向上游到一半的时候由于开启波导之力再加上在水中潜了很长时间，气不足了，晕乎乎地开始往下掉。
就在小智以为自己要凉了的时候，迷你龙和哈克龙出现了。哈克龙把小智背起来向上游去。
在湖岸边，小刚有点担心地问道：“小智不会有事吧？”皮卡丘也“pika，pika”地叫着，小霞则是在心底默默地祈祷着：小智，你一定要平安地回来啊！
这时，天突然下起雨来了，湖水也起漩涡了。然后小智骑着哈克龙出来了，旁边还有一只迷你龙。小霞看到小智后泪水盈眶地说道：“啊？小智，太好了！我就知道你不会有事的！”而后小智将炸弹砸向火箭队：“火箭队，这个还给你们。”
看着定时炸弹上面的倒计时，武藏呆呆地说道：“时间正好到了！”然后，在一声“好讨厌的感觉啊！”中，火箭队的飞天之旅又开始了。
事情结束后，凯撒大叔拿出哈克龙的精灵球给小智，凯撒大叔见小智有些疑惑，便解释一下原因，见状，小智也就不客气地收下了哈克龙的精灵球，并且向凯撒大叔保证一定会照护好哈克龙和迷你龙后就收服了它们。并把杰尼龟和妙蛙种子传送回大木博士的研究所。
之后，小智一行人就辞别凯撒大叔继续着他们的旅行。