斑感到极为惭愧，自己连弟弟都没能守住，当初答应弟弟泉奈要保护好宇智波族人，现在也因此办不到了。斑清楚除了柱间没有人能和他坦诚相待。随后斑询问柱间愿意为了村子割舍扉间还是斑，柱间犹豫了，因为斑足够了解柱间，知道这是柱间的底线，因此，宇智波斑坚持离开木叶，寻找自己想要的“真正的和平”。后来斑人间蒸发，没有人再听到过他的消息。
终结之战：若干年后，斑突然回来向木叶发起袭击，斑企图摧毁自己曾经与柱间一起建立的村子，柱间为了保护村子挺身而出与斑展开激烈的对战。斑利用写轮眼的强大瞳力操纵着尾兽中战斗力最强的九尾与千手柱间决斗，而千手柱间则以仙人模式下的木遁忍术与之应战。
这场惊天动地的战斗后来被刻印在世人的记忆中，夜以继日的战斗改变了战场的地形。最后柱间终于将斑击败，并杀死曾经的朋友，暂时守护木叶的和平，这个大峡谷在后来都被世人称为终结之谷。
木叶为了纪念此次大战为二人建造了屹立在终结之谷两岸的雕像。
幕后计划：终结之战后，宇智波斑并不是世人所想的那样死去，而是存活了下来。他在死前将瞳术“伊邪那岐”封印入自己的右眼，由于万花筒写轮眼的特性，这一瞳术在经过了若干时间之后自动启动，改写了斑被柱间所杀的现实，斑借此获得了重生。
在之前的战斗中，斑从柱间身上咬下了一块肉，在复活后他将肉吐了出来，并移植于伤口处，从而顺利获得了柱间的细胞[2]。但是在移植了柱间细胞后，起初一直不曾有什么反应，连斑自己也慢慢感到疑惑（石碑上记载着“互斥二力，相与为一，孕得森罗万象”，斑对此深信不疑）。时间流逝，直到斑阳寿将尽之时才意外地开启了轮回眼。
与此同时，某个封印也因此解开，斑从封印石——月亮上通灵出十尾的躯壳，称作外道魔像。当然，开启轮回眼后的斑也亲眼目睹了宇智波一族的石碑记录的最后内容（实际上已被黑绝所篡改）。于是，一场针对整个世界的阴谋就这样拉开了帷幕。
斑利用外道魔像为触媒培养柱间细胞，并产生出上一次无限月读开启时产生的白绝。从那时起，斑便利用白绝在外收集情报，了解忍者世界的变更。
这时候的斑年事已高，衰老虚弱而无法行动，只能依靠外道魔像输送查克拉勉强维持生命。为了实现自己的计划，斑将轮回眼移植于仙人之体后裔的年幼长门身上，希望能有朝一日能以轮回天生之术将自己复活。然后斑一边苟延残喘，维持着生命，一边等待着时机。
第三次忍界大战期间，神无毗桥之战结束后，宇智波斑救下濒死状态的宇智波带土，以柱间细胞为其做了个新的身体。斑认为带土这种人是可以助自己完成计划的完美棋子，于是他利用在忍者心脏上的咒印符操纵雾忍，策划野原琳之死事件，并借此让宇智波带土彻底堕入黑暗的深渊。
最终，带土落入了自己的圈套，认同了斑的思想。于是，斑传授带土一些如阴阳遁、宇智波禁术和六道之术等技能，并嘱咐带土拉拢长门，然后在集齐九只尾兽后复活自己，展开“月之眼计划”。把一切都交给宇智波带土后，宇智波斑将自己的部分意志注入一只白绝的右边身体，创造了黑绝，以其作为带土的助手（实际是监视）。
在完成了这些事情之后，斑自己挣脱了连接外道魔像的管道，将“宇智波斑”这个名号托付给带土，随后因身体机能衰竭而死。
忍界大战：第四次忍界大战时期，宇智波斑的尸体被药师兜找到（黑绝引导），兜用秽土转生之术将斑复活，并将其作为和宇智波带土联手的筹码。后来为了扭转战场局势，兜利用二代土影·无召唤出了宇智波斑，看到自己是秽土转生之身，斑感到疑惑不解，但此时他也不知究竟带土和长门的计划出了什么问题。
在第一次与忍者联军交手时，斑便展现出超强的实力，用大范围的火遁、行云流水的体术完全压制忍者联军，导致忍者联军遭受了巨大的伤亡，大批忍者倾尽全力也难以伤到他，甚至无法近身。在三代土影·大野木、五代风影·我爱罗和漩涡鸣人影分身的围攻下，斑开启了万花筒，直接召唤须佐能乎应战。
为了击败宇智波斑，大野木将我爱罗的沙子变轻，我爱罗利用斑脚下的空隙将其拖拽出须佐能乎，此时鸣人以仙法·螺旋手里剑向其发动攻击，眼看着胜利在望，千钧一发之际斑将写轮眼转化为轮回眼，吸收了鸣人的攻击。兜通过秽土转生的二代土影·无向斑叙述了其写轮眼最终会进化为轮回眼的推断，兜的研究成果令斑颇为惊奇。
为了进一步展示力量，斑施展绝招天碍震星，犹如神一般的力量令众人感到惊叹。最终，大野木和我爱罗未能阻止斑的忍术，无数忍者惨遭屠杀。
战场上一片狼藉，斑以通灵之术确认带土并未成功捕捉到九尾后，以树界降诞向存活的大野木等人攻击，此时，九尾感受到大敌当前，主动将查克拉输送给鸣人的影分身对抗宇智波斑，但终究也只是强弩之末，眼看着战场上已经无人可以匹敌斑的力量。
此时，四代雷影·艾和五代火影·纲手凭借“天送之术”抵达战场，五代水影·照美冥也由四代火影的护卫小队施展飞雷神之术及时赶到，五影首次联手抗敌。
一开始，五影凭借人数优势一度压制宇智波斑，但是斑很快便施展木遁分身扭转了局势，当年柱间的力量和斑的力量此时结合在了一起，即便是五影也被打得毫无还手之力。危急时刻，大野木唤起了众影，凭借纲手的查克拉一口气使出了超大范围的尘遁，一口气将木遁分身全灭，并逼退了宇智波斑本人，其他五影趁势配合，斑看似被逼入了绝境。
此时，斑终于认同了五影的实力，于是也决定全力应战，开启了完全体须佐能乎。完全体须佐能乎劈山裂石的威力彻底震惊了五影，眼看五影就要命丧于须佐能乎刀下，此时兜的秽土转生之术被宇智波鼬解除，须佐能乎消失，斑的灵魂开始升天。